Чудачества любви не помеха!

Семнадцатилетний Синъити Кудо обладает развитыми аналитическими способностями, которые помогают ему в расследовании преступлений. Однажды вечером, возвращаясь домой, он становится свидетелем незаконной сделки. Преступники, заметив Кудо, применяют к нему экспериментальный препарат, после чего он теряет сознание.

Придя в себя, Синъити обнаруживает, что его тело уменьшилось до размеров семилетнего ребенка. Чтобы скрыться от преследователей и выяснить обстоятельства произошедшего, он принимает решение сменить место жительства. Под новым именем Конан Эдогава он поселяется у своего знакомого, частного детектива Когоро Мори, и его дочери Ран.

Используя свой детский облик как прикрытие, Конан продолжает заниматься расследованиями, тайно помогая Когоро Мори. Его основная цель - найти организацию, которая разработала препарат, и отыскать способ вернуть себе прежнее тело. В процессе расследования он сталкивается с различными уголовными делами, которые постепенно приближают его к разгадке.