Детектив Конан: Худший из кошмаров

В полицейский участок Токио проникает шпион с целью похищения секретных документов. Агенты различных спецслужб, включая MI6, BND и ЦРУ, оказываются под угрозой. Группа офицеров общественной безопасности во главе с Тору Амуро прибывает на место и вступает в противостояние со злоумышленником. Шпиону удается скрыться на угнанном автомобиле, что приводит к преследованию по городским улицам.

Погоня на высокой скорости создает угрозу масштабного дорожно-транспортного происшествия. Ситуацию разрешает снайперский выстрел агента ФБР Шуичи Акаи, который выводит из строя автомобиль преступника. На следующее утро группа посещает недавно открытый токийский аквариум. Там они находят женщину с гетерохромией, находящуюся в состоянии амнезии и имеющую телесные повреждения.

Женщина не помнит своего имени, а ее мобильное устройство не функционирует. Персонажи принимают решение помочь ей восстановить память и обеспечивают ее сопровождение. Параллельно за развитием событий наблюдает Вермут, член криминальной организации, действующая скрытно.